由于進水水質原因，出水COD超標。進水水質主要包括進水pH值、水溫過低、有機物濃度、懸浮物、難降解或抑菌成分的存在等因素。
1、進水pH
進水pH值過高或過低都會影響生化系統，導致生化系統無法正常運行甚至系統崩潰。沒有適合微生物和反硝化細菌生存的環境。結果，系統處理水質的能力下降，處理后的水質惡化，出水的各項指標增加。
因此，當污水處理廠進水pH值過高或過低時，應及時采取以下措施：
中和預處理或初級處理階段的廢水，檢測污水管網沿線的pH值。異常線段同時被中和。
在預處理和初級處理階段，廢水不斷循環利用，以防止不完全中和。中和調整完成后，緩慢恢復進水。
如果判斷出pH值異常的廢水會影響生化系統，可以加大回流，相當于用沉淀池的廢水稀釋pH值，減少其對生化階段的影響。
2、水溫過低
水溫低會大大降低各種微生物的活性。以氨氮為首的污染物指標濃度首先趨于升高，其次是總氮、COD等。
因此，為盡量減少水溫的影響，保證出水水質達標，可采取以下措施：
每年11月中旬左右開始，可有計劃地逐步減少污泥排放量，緩慢提高污泥濃度，通過增加活性污泥中的細菌數量，保證生化處理階段的處理效果。
水溫過低時，可適當減少生化系統的進水量，降低回流比，增加廢水在生化階段的停留時間。
3、有機物濃度
進水水質發生變化，有機物濃度過高，對活性污泥影響較大。
遇到高負荷時，會發現生化池白色泡沫增多，出水在線COD檢測儀數值增大；
做污泥沉降比時，會發現污泥沉降性能降低，上清液濁度增加；
有機物去除效果降低，好氧區溶解脫氧減少，實驗室人員在觀察生物顯微鏡時會發現原生動物增加。
這時應及時大幅度減少生化系統的進水量。如果條件允許，可以停止進水，降低回流比，增加曝氣量，通過曝氣恢復系統。
4、進水有難處理（或抑制）成分
發現出水的COD升高了，有同事會做個悶暴露測試：
取生化罐混合液約50L，先取少量混勻液沉淀，取上清液過濾，不曝氣測試COD濃度，再通過小型實驗室曝氣器進行恒速曝氣模擬增加停留時間生化系統的時間。
受有機負荷影響時，24-48小時內上清液COD去除率較低。 48小時后，上清液COD去除率可達50%，并繼續穩步下降。
而如果COD去除率72小時保持不變，就要懷疑系統是否進入了耐火或高濃度的抑制物質。
大多數情況下，有難降解的物質，我們會發現BOD的比例很低，甚至B/C都小于0.20；此外，一些難降解的有機物對活性污泥有一定的抑制作用，可用于將活性污泥與泥水分離。也有影響，表現為上清液混濁。
當受到此類廢水的影響時，需要加強厭氧生化處理工藝的運行管理。此外，我們還可以通過添加活性炭來吸附此類有機物。
5、懸浮物太高
生化系統進水懸浮物過高。當進水懸浮物過高時，可以在初級處理階段加入絮凝劑來提高沉降效果，并及時去除。污泥沉降迅速解決；
值得一提的是，這個問題不一定是外在因素造成的，也可能是初級處理段沉積的污泥過多，沒有及時進行污泥處理。是由于過高后隨廢水一起進入生化系統造成的。